- Program pembelajaran Al-Quran dan Tahfizh yang berjenjang hingga sanad qiraah
- Penguatan materi keislaman yang diampu asatizh MTQ Isy Karima
- Penguatan keterampilan dan entreprenur
- Pengenalan ilmu dan keterampilan Tibbun Nabawi
Ilmu Al-Quran dan Tafsir (IQT) di STIQ Isy Karima merupakan bidang studi yang berfokus pada pembelajaran tentang ilmu agama. Dasar-dasar dan pokok keilmuan Islam seperti Ilmu tajwid, akidah, hadits dan sirah nabawiyah, serta akhlaq muslim. Keilmuan yang khas dalam tema al-Quran dan tafsir seperti ragam ulum al-Quran, ilmu qiraat, kaidah tafsir, sejarah dan perkembangan tafsir al-Quran, serta penelitian tentang berbagai penafsiran klasik dan kontemporer. Prodi ini juga menyiapkan para lulusannya dengan kemampuan mengajar dan pengelolaan pesantren dengan beberapa mata kuliah tentang kepengasuhan dan pengeloaan halaqah/lembaga tahfizh, serta kemampuan dalam berwirausaha (Entrepreneurship)
Program I’dad Lughah, STIQ Isy Karima merupakan kelas untuk menyiapkan para mahasiswa kemampuan bahasa Arab yang lebih unggul sehingga siap untuk melanjutkan pendidikan lanjut (perkuliahan) di berbagai perguruan tinggi Islam, baik di dalam negeri ataupun di Luar negeri. Program ini bekerjasama dengan lembaga Majma’ al-Lughah al-Arabiyah, Karangpandan, dan dilaksanakan dalam 1 tahun akademik (2 semester). Fokus utama materi perkuliahan adalah dasar-dasar keilmuan Islam dan bahasa Arab, serta Tahsin Tilawah dan tahfizh al-Qur’an. Lulusan Program ini telah tersebar diberbagai perguruan tinggi Islam di Indonesia, maupun di luar negeri seperti Saudi Arabia, Turkiye, Yaman dan Mesir.
Program perkuliahan Agroteknologi di MTQ Isy Karima ini merupakan kerjasama dengan Universitas Islam Batik Surakarta (UNIBA) untuk memunculkan para kader muda yang “melek” akan dunia pertanian modern. Mahasiswa akan mendapatkan pengetahuan secara teoritis maupun praktikal tentang ilmu dan teknologi yang berkaitan dengan tanaman dan pengelolaannya dengan teknologi modern. Disaat yang sama Pendidikan keislaman dan tahfizh al-Quran akan diajarkan di MTQ Isy Karima. Dengan program ini akan lahir para enterpreneur muda dalam bidang pertanian, serta para ahli pertanian modern yang siap untuk menganalisa dan membuat solusi atas permasalahan yang terjadi di lahan-lahan pertanian dan perkebunan, baik yang bersifat pribadi/ mandiri, juga lahan-lahan wakaf pesantren dan umat Islam secara umum
S1 Pendidikan Bahasa Arab adalah program studi yang dirancang untuk mencetak pendidik, pengajar, dan profesional yang menguasai Bahasa Arab baik secara lisan maupun tulisan, serta memiliki kemampuan untuk mengajarkannya kepada peserta didik di berbagai jenjang pendidikan. Perkuliahan dirancang dengan sistem online atau offline dan sistem modul mandiri dan pendampingan akademik secara berkala. Capaian Utama Lulusan ini diharapkan mampu berbahasa arab aktif, fasih membaca, menulis, berbicara, dan memahami teks Arab klasik dan modern, menguasai ilmu nahwu, sharaf, balaghah, dan ilmu-limu alat lainnya dan mampu mengajarkan Bahasa Arab secara komunikatif dan efektif di sekolah/madrasah/pondok. Selama masa studi, mahasiswa dibimbing untuk menghafal minimal 8 juz Al-Qur’an. Program tahfidz dilakukan secara bertahap dan terintegrasi dengan kegiatan akademik juga tersedia musyrif/ah tahfidz untuk membimbing secara konsisten. Keunggulan dari program ini adalah memiliki kurikulum terpadu antara pendidikan akademik, tahfidz, dan karakter islami, fokus pada pembentukan guru yang unggul dalam Bahasa Arab dan berakhlak Qur’ani. Lulusan Pendidikan Bahasa Arab tidak hanya berijazah sarjana, tapi juga punya bekal hafalan dan pengalaman dakwah.