Ilmu Al-Quran dan Tafsir merupakan bidang studi yang berfokus pada pembelajaran tentang ilmu agama. Dasar-dasar dan pokok keilmuan Islam seperti Ilmu tajwid, akidah, hadits dan sirah nabawiyah, serta akhlaq muslim. Keilmuan yang khas dalam tema al-Quran dan tafsir seperti ragam ulum al-Quran, ilmu qiraat, kaidah tafsir, sejarah dan perkembangan tafsir al-Quran, serta penelitian tentang berbagai penafsiran klasik dan kontemporer.

Prodi IQT di STIQ Isy Karima memiliki kekhasan prodi yang terintregrasi dengan program tahfizh yang berjenjang hingga sanad berbagai qiraat. Prodi ini juga menyiapkan para lulusannya dengan kemampuan mengajar dan pengelolaan pesantren dengan beberapa mata kuliah tentang kepengasuhan dan pengeloaan halaqah/lembaga tahfizh, serta kemampuan dalam berwirausaha (Entrepreneurship)

Dengan kurikulum yang ada, berikut ini profil lulusan IQT STIQ Isy Karima; 1) Kader Ulama Ahli ilmu al-Quran dan tafsir, 2) Peneliti bidang al-Quran dan Tafsir, 3) Dai, Mubaligh, Penyuluh agama, 4) Pendidik ilmu-ilmu keislaman khusunya pembelajaran al-Qur’an, tahfizh dan tafsirnya, baik berbasis pesantren ataupun non pesantren